Beim Farbfilterverfahren wird die Vorlage in drei Scandurchgängen mit weißem Licht beleuchtet, und in jedem Durchgang wird den CCDs (Charged Coupled Device) ein anderer Farbfilter vorgesetzt (Rot, Grün und Blau). So erhält man die Farbanteile jedes einzelnen Punktes für Rot, Grün und Blau. Dieses Additive Farbmodell entspricht der Darstellungsweise der Bildpunkte auf dem Monitor. Additiv bedeutet, dass 100 Prozent jeder Grundfarbe Weiß ergibt. Es gibt nur wenige Scanner, die mit diesem Verfahren arbeiten, dass auch sehr langsam ist. Vor der CCD-Zeile ist eine aufwendige Mechanik positioniert.
Bei älteren Scannermodellen war noch für jede Beleuchtungsfarbe ein "Balken" zuständig so konnte der Scannvorgang mit 100 dpi schon mal bis zu 10 Min dauern.
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