Von Stützpunkten in Ägypten aus überfielen die Araber die Berberstaaten im Westen. Im 8. Jahrhundert eroberten sie Marokko und waren damit bis zur Westküste des afrikanischen Kontinents vorgedrungen. Während sich die Berber an der Küste zum Islam bekehren ließen, zogen sich viele andere ins Atlasgebirge und in die Sahara zurück. Arabische Minderheiten errichteten autokratische (von einem Herrscher mit unumschränkter Staatsgewalt regierte) Gemeinwesen in Algerien und Marokko. Die christlichen Staaten von Alwa und Makuria im Sudan wurden erobert, nur das christliche Königreich Nobatia war stark genug, den Eindringlingen zu widerstehen. Es erzwang den Abschluss eines Vertrags, der seine Unabhängigkeit für über 600 Jahre aufrechterhielt. Entlang der Küsten blieben die arabischen Eroberer über einige Jahrhunderte eine kleine herrschende Minderheit.
Im 8. Jahrhundert wurde der Handel durch die Sahara üblich. Karawanenführer und Missionare verbreiteten politische, religiöse und gesellschaftliche Werte unter den Menschen entlang der Handelsrouten. Zuvor noch hatten muslimische Eindringlinge aus dem Jemen die Einwohner des Küstenstaates Aksum ins Landesinnere verdrängt und eine Reihe von Stadtstaaten wie Adal und Harar gegründet. Das Rote Meer wurde nun von muslimischen Händlern dominiert.
Verschiedene um die Vorherrschaft kämpfende Herrschergeschlechter entstanden an der nordafrikanischen Küste. Im 8. Jahrhundert eroberten nordafrikanische Muslime den größten Teil der Iberischen Halbinsel. Ihre Überfälle und Eroberungsfeldzüge gegen das christliche Europa dauerten noch einige Jahrhunderte an. Zur Zeit der Kreuzzüge beherrschten einige wenige hoch entwickelte islamische Staaten den südlichen und östlichen Teil des Mittelmeeres. Im 14. Jahrhundert ergab sich der christliche Sudan den Armeen des mameluckischen Ägypten. Die Türken aus dem Osmanischen Reich eroberten Ägypten im Jahr 1517, und innerhalb von 50 Jahren hatten sie nach außen hin die Herrschaft über die nordafrikanische Küste übernommen. Die tatsächliche Gewalt blieb jedoch in den Händen der Mamelucken, die Ägypten bis zu ihrer Bezwingung durch Napoléon Bonaparte im Jahr 1798 regierten. Die Äthiopier wurden von den Armeen des Sultanats Adal überrannt, aber sie besiegten im Jahr 1542 die Muslime mit Hilfe Portugals.
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